Μέσω σύγχρονων συστημάτων νευροπλοήγησης και ειδικών μικροχειρουργικών εργαλείων, ο χειρουργός καθοδηγείται στις πιο δυσπρόσιτες περιοχές του εγκεφάλου, μέσα από τομές λίγων εκατοστών. Έτσι καθίσταται δυνατή η αφαίρεση καλοήθων και κακοήθων όγκων (πρωτοπαθών και μεταστατικών) καθώς και αγγειακών δυσπλασιών.
Η ελάχιστα επεμβατική χειρουργική του εγκεφάλου περιλαμβάνει επίσης τη χρήση του ενδοσκοπίου, μέσω της ρινικής κοιλότητας, στη βάση του κρανίου, γεγονός που επιτρέπει την πρόσβαση σε βαθύτερες περιοχές του εγκεφάλου (πρόσθιος κρανιακός βόθρος, τούρκικο εφίππιο, απόκλιμα, κλπ.). Με αυτόν τον τρόπο αντιμετωπίζονται με το βέλτιστο τρόπο αδενώματα της υποφύσεως, κύστεις του Rathke, μηνιγγιώματα, χορδώματα, κρανιοφαρυγγιώματα και άλλες παθήσεις των εν λόγω ανατομικών περιοχών. Το βασικό πλεονέκτημα της ελάχιστα επεμβατικής χειρουργικής του εγκεφάλου είναι η ελάττωση της νοσηρότητας που προκαλείται από τη χειρουργική προσπέλαση. Έτσι, ο ασθενής έχει μικρότερες ουλές (ή και καθόλου), λιγότερο μετεγχειρητικό πόνο, μικρότερη διάρκεια νοσηλείας και ταχύτερη αποκατάσταση.